| |
雙連埤的青將魚
記錄編號:83NTHU0105022
研 究 生:林思民 Lin, Szu-min
論文名稱:青將魚粒線體去氧核醣核酸控制區(D-loop)之研究
論文名稱:Characterization of Medaka Fish (Oryzias latipes) mtDNA D- loop
指導教授:曾晴賢;許宗雄;黃秉乾 Tzeng, C.S.;Hui, T.H. ;Huang, P.C.
《摘 要》
為瞭解青將魚臺灣雙連埤族群與日本族群間的基因差異,並解決分類定位,的相關問題,本實驗選擇青將魚粒線體DNA的控制區 (displacement
loop,或簡稱D-loop)進行核酸定序及比對工作。利用已知脊椎動物粒線體DNA排序的保守區段,在D-loop外圍的 Cytochrome b
gene及12S rRNA gene上合成引子(primer),並利用雙去氧核醣核酸鏈停止法(dideoxynucleotide chain
termination)加以定序。定序得到臺灣青將魚族群D-loop附近序列約1400 base pairs,日本族群約1500 base
pairs,整段包含完整的D-loop和三個轉譯核醣核酸基因(tRNA-Thr、tRNA-Pro及tRNA-Phe),以及部份的Cyto- chrome b
gene及12S rRNA基因。在D-loop 前段並發現一段以11-bp反覆重複(tandem
repeat)的保守序列,其重複次數在單一個體內可由七次至十四次不等,而造成單一體內的粒線體基因多形化現象。比對十七隻採自單一族群(宜蘭雙連埤)之臺灣青將魚及三隻日本青將魚,可發現族群內的相似度為99%以上,族群間的相似度僅為90.4%。這種族群間的差異程度在類似的族群研究裡,甚至以大過某些魚類之種間差異,顯示臺灣和日本這兩族群間的遺傳差異已相當顯著。但是由於兩者之間在外型上尚無法明確判別,且缺乏其他領域相關的研究報告,關於臺灣族群的分類定位尚須進行更多的實驗謹慎探討。
|